MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 8783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021881	TG	3	6	348203	348208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021881	ATC	2	6	348393	348398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_021881	AT	3	6	348429	348434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021881	TGGT	2	8	348458	348465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021881	TAG	2	6	348486	348491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021881	GAT	2	6	348492	348497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021881	TATT	2	8	348517	348524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021881	CAGT	2	8	348537	348544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_021881	GTA	2	6	348596	348601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021881	TGTA	2	8	348809	348816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021881	T	6	6	348839	348844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021881	TAA	2	6	348849	348854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021881	CAG	2	6	348855	348860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_021881	TGT	2	6	349003	349008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021881	TGAG	2	8	349024	349031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021881	ACT	2	6	349053	349058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_021881	TAGAA	2	10	349072	349081	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021881	AGTT	2	8	349082	349089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021881	AT	4	8	349638	349645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021881	TTG	2	6	350103	350108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021881	GTT	2	6	350111	350116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021881	GGT	2	6	350152	350157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_021881	TGT	2	6	350166	350171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021881	TTC	2	6	350179	350184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_021881	T	6	6	350185	350190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021881	ACGTC	2	10	350225	350234	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1527	NC_021881	ATT	2	6	351501	351506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021881	TGC	2	6	351580	351585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_021881	TGG	2	6	351586	351591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021881	TTG	2	6	353619	353624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021881	CAGC	2	8	353637	353644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_021881	TAGC	2	8	353676	353683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_021881	TTTG	2	8	353738	353745	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021881	TAA	2	6	357958	357963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021881	TCT	3	9	358000	358008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_021881	TAG	2	6	358054	358059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021881	ATTT	2	8	358078	358085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021881	ACT	2	6	358092	358097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_021881	CG	3	6	358102	358107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_021881	TA	3	6	358114	358119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021881	TAA	2	6	358214	358219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021881	T	6	6	358220	358225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021881	GTTT	2	8	358249	358256	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021881	GAG	2	6	359756	359761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021881	GCA	2	6	360071	360076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_021881	TAC	2	6	360113	360118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_021881	CAG	2	6	360124	360129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_021881	TTA	2	6	360131	360136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021881	AAG	2	6	361039	361044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021881	CTG	2	6	361129	361134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_021881	ATA	3	9	361242	361250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021881	AG	3	6	361280	361285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021881	GCT	2	6	361288	361293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_021881	TAC	2	6	361446	361451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_021881	TAAA	2	8	361477	361484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021881	AAC	2	6	361488	361493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_021881	ATA	2	6	361561	361566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021881	GT	3	6	361589	361594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021881	TGC	2	6	361597	361602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_021881	ATA	3	9	361607	361615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021881	AG	3	6	361645	361650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021881	GCT	2	6	361653	361658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021881	TGC	2	6	361701	361706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021881	GAT	2	6	361711	361716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021881	TGA	2	6	363203	363208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021881	TAT	2	6	363280	363285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021881	T	6	6	363291	363296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021881	CATG	2	8	363324	363331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_021881	AG	3	6	363370	363375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021881	T	6	6	363416	363421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021881	ATT	2	6	363428	363433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021881	ATAGT	2	10	363442	363451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021881	TGT	2	6	364152	364157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021881	ATA	2	6	369459	369464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021881	TAGA	2	8	369552	369559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021881	CAT	2	6	372364	372369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_021881	GCA	2	6	376846	376851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1580	NC_021881	N	100	100	383164	383263	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021881	AGT	2	6	383292	383297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021881	TGA	2	6	383328	383333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021881	AGT	2	6	383376	383381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021881	TGA	2	6	383412	383417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_021881	TGAGGT	2	12	383493	383504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_021881	GTG	2	6	383557	383562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_021881	AGA	2	6	383610	383615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021881	TGT	2	6	383619	383624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021881	AGT	2	6	383635	383640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_021881	TAC	2	6	383694	383699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_021881	CGCAG	2	10	383700	383709	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1597	NC_021881	GATACT	2	12	383719	383730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1599	NC_021881	A	6	6	383773	383778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_021881	AAG	2	6	383797	383802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021881	AAG	2	6	383819	383824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021881	CTA	2	6	383873	383878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_021881	AT	3	6	383891	383896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021881	TCA	2	6	383898	383903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1606	NC_021881	AG	3	6	383992	383997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021881	AGT	2	6	384019	384024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1610	NC_021881	GAC	2	6	384865	384870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021881	TTC	2	6	384880	384885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_021881	GTT	2	6	384968	384973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021881	AGA	2	6	384977	384982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021881	TGC	2	6	385008	385013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1616	NC_021881	AT	3	6	385097	385102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021881	CTT	2	6	385195	385200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_021881	AAAG	2	8	385237	385244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_021881	ACT	2	6	385251	385256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1621	NC_021881	GAC	2	6	385284	385289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_021881	AGA	2	6	385305	385310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021881	AT	3	6	385317	385322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021881	TG	3	6	385375	385380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021881	TAA	2	6	385401	385406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_021881	TAT	2	6	385485	385490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_021881	TA	3	6	385543	385548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021881	TTG	2	6	385549	385554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021881	CTT	2	6	385754	385759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_021881	A	6	6	385778	385783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021881	T	6	6	385796	385801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021881	ACC	3	9	385821	385829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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